Seminar im SS 1998

Bioinformatik

Prof. Dr. N. Blum, Dr. M. Vingron, M. Nikolaidou, C. Rick

Beschreibung: Das Human Genome Projekt hat mittlerweile in der Informatik ein eigenes, sehr aktives Forschungsgebiet hervorgebracht: die sogenannte Computational Biology.

Im Rahmen des Seminars sollen verschiedene bei der Sequenzierung und Analyse der DNS auftretende kombinatorische Probleme vorgestellt und die zu ihrer Lösung entwickelten Algorithmen diskutiert werden. Unter anderem sind Vorträge zu folgenden Themen geplant:

Zu jedem Themengebiet sollen sowohl theoretische als auch praktische Ansätze zur Sprache kommen.

Zeit und Ort: 14tägig, Di 16-18 Uhr und Mi 10-12 Uhr, Raum N102

Beginn: 14./15. April 1998 - Terminübersicht

Vorbesprechung: Donnerstag, den 12. Februar 1998 um 13 c.t. in Raum N102

Bereich: A

Voraussetzungen: Vordiplom; Interesse am Entwurf und der Analyse von diskreten Algorithmen und ihrer Anwendung in der Molekularbiologie

Nachfolge-/Begleitveranstaltungen: keine

Vortragsmodus: Einzelvortrag, wobei für jeweils zwei Vorträge aufgrund der inhaltlichen Verzahnung eine enge Kooperation der Teilnehmer wünschenswert ist. Ein Vortrag wird durch eine schriftliche Ausarbeitung vorbereitet werden.

Plätze: 12

Literatur:

Terminübersicht:

Datum Thema Referent Schriftliches
Di, 28.4. Alignment von DNA-Sequenzen Olaf Schmidt Vortrag1
Di, 12.5. Shortest Superstrings Michael Austermann Vortrag2
Di, 26.5. Sequence Assembly Patrick Schumacher Vortrag3
Di, 9.6. Pattern Identification (Theorie) Christopher Kohlhaas Vortrag4
Mi, 10.6. Pattern Identification (Praxis) Bettina Lademann Vortrag5
Di, 23.6. Phylogenetic Trees (Theorie) Peter Krupp Vortrag6
Mi, 24.6. Phylogenetic Trees (Praxis) Florian Sohler Vortrag7

Jeweils Dienstags 16-18 Uhr bzw. Mittwochs 10-12 Uhr, Raum N102

Maria Nikolaidou, Claus Rick


23. April 1998 - rick@informatik.uni-bonn.de